五念门是《往生论》的又一重要内容。
第一礼拜门，“身业礼拜阿弥陀佛如来、应、正遍知，为生彼国意故”，不仅是指礼拜阿弥陀佛这一身业，而且含有归命阿弥陀佛的意思，归命在身业上的表现就是礼拜。
第二赞叹门，“口业赞叹，称彼如来名，如彼如来光明智相，如彼名义，欲如实相应故”，赞叹不仅是口业，因为如来光明智相是根本无分别智、后得无分别智即慈悲的作用，所以由此慈悲方便与如实修行相应的就是赞叹门。
第三作愿门，“心常作愿，一心专念，毕竟往生安乐国土，欲如实修行奢摩他故”，这一门虽然没有如前二门所记的那样是身业或是口业，但后面的解义分明确说是意业，一心专念作愿往生净土，修奢摩他行。奢摩他，就是心一境相，心专注于某一对象，心进入寂静的状态，所以奢摩他又称为心的寂静相。在这种状态观察世俗的世界，就是观察门的毗婆舍那。
第四观察门，“智慧观察，正念观彼，欲如实修行毗婆舍那故。彼观察有三种。何等三种。一者观察彼佛功德国土庄严，二者观察阿弥陀功德庄严，三者观察彼佛菩萨功德庄严”，观察门的内容占据了《净土论》的大半，解义分中称为智业。
五念门的主干是作愿、观察二门，中心是奢摩他、毗婆舍那。奢摩他和毗婆舍那的行业是大乘佛教的重要的行业，汉译分别作止和观，是瑜伽唯识论书中的重要用语。因此作愿和观察二门是瑜伽行的净土教式的论述。
第五回向门，“不舍一切苦恼众生，心常作愿回向为首成就大悲心故”，回向一切众生，往生净土。
五念门以止观为中心，前后配以礼拜、赞叹、回向。这种行业体系与《大乘庄严经论》、《中边分别论》、《摄大乘论》等瑜伽唯识系统的论书中所示的实践体系有关。例如，赞叹、作愿、观察三门中有“如实修行”一语，在《究竟一乘宝性论》中和“遍修行”并用，作“如实修行遍修行”，是唯识论书中与根本无分别智、无分别后得智相对应的重要用语。
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